当院には、寄付講座、社会連携講座が設置されています。

東京大学における寄付講座とは、本学における教育研究の進展および充実を目的とし、個人または団体の寄附による基金をもってその基礎的経費を賄うものとして設置される講座をいいます。また、社会連携講座とは、公共性の高い共通の課題について、本学と共同して研究を実施しようとする民間など外部の機関から受け入れる経費などを活用して設置される講座をいいます。

なお、上記講座のうち、一部の寄付講座および社会連携講座は、新たな臨床医学や医療関連サービスの研究と開発を行う組織である「22世紀医療センター」に設置されています。