東京大学脳神経外科の後期臨床研修プログラムでは、以下のような優れた関連病院脳神経外科の指導者との協力により、専門医教育が行われています。これら関連病院脳神経外科において、各分野で卓越した技術を持つ専門医からの直接の指導を受けられることが、このプログラムの大きな特徴です。

連携施設

がん・感染症センター都立駒込病院 脳神経外科
虎の門病院 脳神経外科
東京警察病院 脳神経外科
東京都立多摩総合医療センター 脳神経外科
社会福祉法人三井記念病院 脳神経外科
都立神経病院 脳神経外科
埼玉医科大学 総合医療センター 脳神経外科
富士脳障害研究所附属病院 脳神経外科
日本赤十字社医療センター・脳神経外科
公立昭和病院 脳神経外科
社会医療法人 社団陽正会 寺岡記念病院 脳神経外科
独立行政法人国立がん研究センター中央病院 脳脊髄腫瘍科
独立行政法人 地域医療機能推進機構 JCHO東京新宿メディカルセンター脳神経外科・脳神経血管内治療科
会津中央病院 脳神経外科
東京逓信病院 脳神経外科
社会医療法人社団 森山医会森山記念病院 脳神経外科
東京都健康長寿医療センター脳神経外科・脳血管内治療科
宇都宮脳脊髄センター・ シンフォニー病院
東京大学医科学研究所附属病院 脳腫瘍外科
国立成育医療研究センター 脳神経外科

関連施設

自治医科大学 脳神経外科
埼玉医科大学国際医療センター 脳神経外科・脳卒中外科/脳血管内治療科/脳脊髄腫瘍科 
杏林大学医学部 脳神経外科
帝京大学医学部 脳神経外科
東京都立墨東病院 脳神経外科
国立研究開発法人・特定機能病院 国立国際医療研究センター病院 脳神経外科
帝京大学ちば総合医療センター脳神経外科・脳卒中センター
帝京大学医学部附属溝口病院 脳神経外科
医療法人社団KNI北原国際病院 脳神経外科
NTT東日本関東病院 脳神経外科、ガンマナイフセンター
埼玉医科大学病院 脳神経外科
関西医科大学附属病院脳神経外科